Cơ quan thuế cũng tăng cường giám sát hoạt động của DN để kịp thời phát hiện các trường hợp có kinh doanh nhưng không kê khai hoặc chưa đưa vào quản lý; tập trung đẩy mạnh công tác thanh tra đối với các DN có các hoạt động giao dịch liên kết, DN có dấu hiệu chuyển giá, thanh tra theo chuyên đề đối với những lĩnh vực tiềm ẩn rủi ro cao. Kết quả năm 2012 đã thanh tra, kiểm tra 55.850 DN, tăng 11,2% so với năm 2011. Tổng số truy thu, truy hoàn và phạt đạt trên 9.000 tỷ đồng tăng trên 20% so với năm 2011. Đối với các DN lỗ có dấu hiệu chuyển giá đã thanh tra, kiểm tra tại 2.027 DN, đã kiến nghị truy thu xử phạt khoảng 683,5 tỷ đồng, giảm lỗ trên 3.700 tỷ đồng, giảm khấu trừ 202 tỷ đồng và nộp vào NSNN trên 200 tỷ đồng. Bên cạnh đó, ngành thuế đã đẩy mạnh cải cách thủ tục hành chính thuế và ứng dụng công nghệ thông tin để tự động hoá các quy trình tiếp nhận, giải quyết hồ sơ thủ tục hành chính thuế trong đó đã triển khai dự án kê khai thuế qua mạng tại 50 Cục Thuế các địa phương, với trên 200.000 DN đăng ký và kê khai nộp thuế qua mạng.

Với việc triển khai các biện pháp quyết liệt nên đến hết 31/12/2012, tổng thu NSNN ước đạt 742.950 tỷ đồng, bằng 100,3% so với dự toán, bằng 100,2% so với số báo cáo Quốc hội, tăng 5,5% so với thực hiện năm 2011. Riêng số thu do ngành thuế quản lý ước đạt 607.844 tỷ đồng, bằng 104,5% so với dự toán (tương ứng vượt 26.244 tỷ đồng), bằng 103,2% so với số báo cáo Quốc hội, tăng 12,4% so với thực hiện năm 2011. Trong đó thu từ dầu thô ước đạt trên 140.000 tỷ đồng, bằng 161% so với dự toán và tăng 27,1% so với năm 2011; thu nội địa ước đạt 467.737 tỷ đồng, đạt 94,6% so với dự toán và tăng 8,6% so với thực hiện năm 2011; thu nội điạ không kể tiền sử dụng đất ước đạt gần 423.000 tỷ đồng, bằng 92,3% so với dự toán. Đến 31/12/2012, cả nước có 48/63 địa phương hoàn thành dự toán số thu do ngành quản lý, 44/63 địa phương hoàn thành dự toán thu nội địa.

Quan tâm dõi theo từng bước phấn đấu của ngành thuế trong suốt 365 ngày của năm 2012, Chủ nhiệm Uỷ ban Tài chính - Ngân sách Quốc hội Phùng Quốc Hiển đánh giá cao và nhiệt liệt biểu dương ý chí và tinh thần nỗ lực, cố gắng không mệt mỏi của ngành thuế để hoàn thành nhiệm vụ động viên nguồn lực cho NSNN. Tuy nhiên, trong khi nói lời chúc mừng, Chủ nhiệm Phùng Quốc Hiển cũng lưu ý, dự toán năm 2013, Quốc hội, Chính phủ giao cho ngành thuế là 644.500 tỷ đồng, trong đó thu từ dầu thô là 99.000 tỷ đồng, thu nội địa là 545.500 tỷ đồng, tăng gần 20% so với thực hiện năm 2012. Đây là một nhiệm vụ rất khó khăn trong bối cảnh kinh tế năm 2013 vẫn còn phải đối mặt với nhiều khó khăn và dư địa tăng thu ngân sách không còn nhiều. Do đó, Bộ Tài chính và Tổng cục Thuế cần phối hợp chặt chẽ với Uỷ ban Tài chính - Ngân sách Quốc hội để nghiên cứu xây dựng các giải pháp để quản lý và động viên có hiệu quả các nguồn thu cho NSNN.

Trong rất nhiều các nội dung được bàn thảo tại buổi làm việc, Chủ nhiệm Phùng Quốc Hiển giành sự quan tâm đến các vấn đề sửa đổi bổ sung trong Luật Thuế GTGT và Luật Thuế TNDN dự kiến sẽ trình Quốc hội trong năm 2013, nhất là các vấn đề về ngưỡng tính thuế, hoàn thuế GTGT; mức thuế suất thuế TNDN; thuế xuất khẩu tài nguyên; các khoản thu phí, lệ phí; thu thuế đối với casino; xử lý nợ xấu ngân hàng; chống chuyển giá.... Với quan điểm, công tác chăm lo nguồn lực cho ngân sách quốc gia là trách nhiệm chung của cả hệ thống chính trị, Chủ nhiệm Phùng Quốc Hiển đề nghị Bộ Tài chính, Tổng cục Thuế tăng cường hơn nữa việc phối kết hợp với các ngành, các cấp, nhất là với Uỷ ban Tài chính - Ngân sách Quốc hội để kiến tạo thêm nhiều giải pháp quản lý hiệu quả nhằm đảm bảo hoàn thành tốt nhiệm vụ động viên nguồn lực trong mọi hoàn cảnh, trước mắt là thu NSNN năm 2013 đạt kết quả cao nhất./.